据《科學時報》2005年11月8日報道：近日，中科院計算所与清華大學計算机系式籤署建立戰略合作伙伴關係議書，雙方將在科學研究、人才培養、學術交流、發展戰略等方面開展廣泛合作，共同推動我國計算机科學技術創新体系建設。中科院計算所所長、中國工程院院士李國杰表示，在与清華大學開展合作的過程中，將淡化“單位”概念，共同制定學術水平評价標准，尤其是要率先取消SCI評价標准。

李國杰説，目前，世界各國的計算机學科教育的發展有不同模式，有些封閉保守，有些開放包容。較好的學科教育發展模式應該是醫學和法律，因為醫學和法律教育，把所有相關的知識都吸納在本學科中；此外，工程學科也有較好的吸納性。但在生物系則一般不會開設電路設計等相關性較弱的課程。

“生物學和計算机都是發散的學科，其他學院可開設各种与計算机有關的課程。”李國杰説，“計算机科學如果像數學一様把相關的知識都推出去下很少的内容，那么算机學院將來教什么？”

一直以來，國内衡量科研學術水平的標准SCI。“SCI = Science Citation Index（科學引文索引），拿SCI來衡量學術水平，是非常錯誤的，SCI成了Stupid ChineseIdea（中國人愚蠢的思想）。”李國杰對目前國内學術水平的評价標准大不以為然，“其實，SCI應該理解為Significant Change & Impact（論文引發的重大變革与影響）。”

在談到計算机科學的發展方向時，李國杰説，今后，計算机領域要大大加强与物理學、生命科學及社會科學的交叉研究，特别要加强以超級計算机為基礎的計算机模擬与仿真研究。事實上，融合計算机科學、運籌學、產遽工程、數學、管理學、决策學、社會科學和法律學等學科的“服務科學”已經產生，計算机科學要創建新的技能和市場來提供高价值的服務。

李國杰介紹説，中科院計算所未來的科研方向有兩條主綫，一是為我國實現低成本信息化提供核心和關鍵技術，研制低成本且安全适用的芯片、終端、服務器、軟件和解决方案；二是為我國建設惠及大眾、可信的下一代互聯网提供核心和關鍵技術，使中國科學院在我國网絡技術發展中真正起到骨干shit~与引領作用。計算所將通過与清華大學等國内著名大學及相關研究所的合作，加强基礎研究、研究生培養和發展戰略研究，共同承擔國家重大科研任務，真正提高我國信息領域的核心競爭力。

李國杰表示，雙方的戰略合作，將淡化“單位”概念，互相做人員評价（晉升）

和博士生論文評審，雙方合作發表文章不分第一第二作者，共同申請課題，共同制定學術水平評价標准，尤其是要率先取消SCI評价標准。